Η Eurolegue ανακοίνωσε το πρόγραμμα της κανονικής περιόδου της διοργάνωσης για τη σεζόν 2016-17. Ο Παναθηναϊκός ξεκινά τις υποχρεώσεις του την Παρασκευή 14 Οκτωβρίου υποδεχόμενος τη Ζαλγκίρις Κάουνας και τις ολοκληρώνει την Πέμπτη 6 Απριλίου αντιμετωπίζοντας τη Μακάμπι εκτός έδρας.

Αναλυτικά το πρόγραμμα του Παναθηναϊκού:

Παρασκευή 14 Οκτωβρίου Παναθηναϊκός – Ζάλγκιρις

Παρασκευή 21 Οκτωβρίου ΤΣΣΚΑ Μόσχας – Παναθηναϊκός

Τετάρτη 26 Οκτωβρίου Μπάμπεργκ – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 28 Οκτωβρίου Παναθηναϊκός – Ερυθρός Αστέρας

Παρασκευή 4 Νοεμβρίου Αναντολού Εφές – Παναθηναϊκός

Πέμπτη 10 Νοεμβρίου Παναθηναϊκός – Μακάμπι

Τετάρτη 16 Νοεμβρίου Ρεάλ Μαδρίτης – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 18 Νοεμβρίου Παναθηναϊκός – Ολυμπιακός

Παρασκευή 25 Νοεμβρίου Παναθηναϊκός – Νταρουσάφακα

Παρασκευή 2 Δεκεμβρίου Μπαρτσελόνα – Παναθηναϊκός

Πέμπτη 8 Δεκεμβρίου Παναθηναϊκός – Γαλατάσαραϊ

Παρασκευή 16 Δεκεμβρίου Παναθηναϊκός – Φενέρμπαχτσε

Τετάρτη 21 Δεκεμβρίου Αρμάνι Μιλάνο – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 23 Δεκεμβρίου Λαμποράλ Κούτσα – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 30 Δεκεμβρίου Ούνικς Καζάν – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 6 Ιανουαρίου Ολυμπιακός – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 13 Ιανουαρίου Παναθηναϊκός – Αναντολού Εφές

Πέμπτη 19 Ιανουαρίου Φενέρμπαχτσε – Παναθηναϊκός

Τρίτη 24 Ιανουαρίου Παναθηναϊκός – Μπαρτσελόνα

Πέμπτη 26 Ιανουαρίου Ερυθρός Αστέρας – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 3 Φεβρουαρίου Γαλατάσαραϊ – Παναθηναϊκός

Πέμπτη 9 Φεβρουαρίου Παναθηναϊκός – Μπάμπεργκ

Παρασκευή 24 Φεβρουαρίου Παναθηναϊκός – Ούνικς Καζάν

Παρασκευή 3 Μαρτίου Νταρουσάφακα – Παναθηναϊκός

Πέμπτη 9 Μαρτίου Ζάλγκιρις – Παναθηναϊκός

Πέμπτη 16 Μαρτίου Παναθηναϊκός – Ρεάλ Μαδρίτης

Τρίτη 21 Μαρτίου Παναθηναϊκός – Αρμάνι Μιλάνο

Πέμπτη 23 Μαρτίου Λαμποράλ Κούτσα – Παναθηναϊκός

Παρασκευή 31 Μαρτίου Παναθηναϊκός – ΤΣΣΚΑ Μόσχας

Πέμπτη 6 Απριλίου Μακάμπι – Παναθηναϊκός